A versatile and interoperable computational framework for the analysis and modeling of COVID-19 disease mechanisms

Published in , 2025

A. Niarakis, M. Ostaszewski, A. Mazein, I. Kuperstein, M. Kutmon, M. E. Gillespie, A. Funahashi, M. L. Acencio, A. Hemedan, M. Aichem, K. Klein, T. Czauderna, F. Burtscher, T. G. Yamada, Y. Hiki, N. F. Hiroi, F. Hu, N. Pham, F. Ehrhart, E. L. Willighagen, A. Valdeolivas, A. Dugourd, F. Messina, M. Esteban-Medina, M. Peña-Chilet, K. Rian, S. Soliman, S. S. Aghamiri, B. L. Puniya, A. Naldi, T. Helikar, V. Singh, M. F. Fernández, V. Bermudez, E. Tsirvouli, A. Montagud, V. Noël, M. P. de Leon, D. Maier, A. Bauch, B. M. Gyori, J. A. Bachman, A. Luna, J. Pinero, L. I. Furlong, I. Balaur, A. Rougny, Y. Jarosz, R. W. Overall, R. Phair, L. Perfetto, L. Matthews, D. A. B. Rex, M. Orlic-Milacic, M. G. L. Cristobal, B. De Meulder, J. M. Ravel, B. Jassal, V. Satagopam, G. Wu, M. Golebiewski, P. Gawron, L. Calzone, J. S. Beckmann, C. T. Evelo, P. D’Eustachio, F. Schreiber, J. Saez-Rodriguez, J. Dopazo, M. Kuiper, A. Valencia, O. Wolkenhauer, H. Kitano, E. Barillot, C. Auffray, R. Balling, R. Schneider, . (2025). “A versatile and interoperable computational framework for the analysis and modeling of COVID-19 disease mechanisms.” **.

Download paper

Recommended citation: A. Niarakis, M. Ostaszewski, A. Mazein, I. Kuperstein, M. Kutmon, M. E. Gillespie, A. Funahashi, M. L. Acencio, A. Hemedan, M. Aichem, K. Klein, T. Czauderna, F. Burtscher, T. G. Yamada, Y. Hiki, N. F. Hiroi, F. Hu, N. Pham, F. Ehrhart, E. L. Willighagen, A. Valdeolivas, A. Dugourd, F. Messina, M. Esteban-Medina, M. Peña-Chilet, K. Rian, S. Soliman, S. S. Aghamiri, B. L. Puniya, A. Naldi, T. Helikar, V. Singh, M. F. Fernández, V. Bermudez, E. Tsirvouli, A. Montagud, V. Noël, M. P. de Leon, D. Maier, A. Bauch, B. M. Gyori, J. A. Bachman, A. Luna, J. Pinero, L. I. Furlong, I. Balaur, A. Rougny, Y. Jarosz, R. W. Overall, R. Phair, L. Perfetto, L. Matthews, D. A. B. Rex, M. Orlic-Milacic, M. G. L. Cristobal, B. De Meulder, J. M. Ravel, B. Jassal, V. Satagopam, G. Wu, M. Golebiewski, P. Gawron, L. Calzone, J. S. Beckmann, C. T. Evelo, P. D’Eustachio, F. Schreiber, J. Saez-Rodriguez, J. Dopazo, M. Kuiper, A. Valencia, O. Wolkenhauer, H. Kitano, E. Barillot, C. Auffray, R. Balling, R. Schneider, . (2025). "A versatile and interoperable computational framework for the analysis and modeling of COVID-19 disease mechanisms." .
Download Paper | Download Slides